טיסות מאתונה לישראל יוצאות מנמל התעופה הבינלאומי של אתונה אלפתריוס וניזלוס, ונוחתות בנמל התעופה בן גוריון.
מדובר באחד מהקווים הפעילים והפופולריים הן בקרב תיירים יוונים המבקרים בישראל והן בקרב ישראלים שטסים לחופשות בעיר הבירה היוונית
את הקו מפעילות חברות התעופה אל על,ישראייר, ארקיע ו-Aegean Airlines, כמו גם חברות צ'רטר שונות, המציעות מגוון רחב של טיסות ישירות מדי יום.
בחודשי הקיץ והחגים, תקופות השיא בתיירות, מספר הטיסות עולה, וניתן למצוא בין 20 ל-30 טיסות שבועיות בין שתי המדינות.
משך הטיסה מאתונה לישראל קצר ונוח, כשעה ו-45 דקות בממוצע, כאשר מרבית הטיסות כוללות שירותים בסיסיים לנוסעים, אפשרות לבחירת מושב מראש, הוספת מזוודה, ולעיתים אף כיבוד קל בטיסה.
הקו מאתונה לישראל נחשב לאחד ממסלולי הטיסה המרכזיים המחברים בין יוון לישראל, ומציע חיבור מהיר, נגיש ומשתלם בין שתי בירות תיירותיות אהובות במיוחד.